《科技日报》及科技部网站刊发尚勇的这番讲话以后，引起了轩然大波。中国科学院院士、中国科学院理论物理所退休的物理学家何祚庥写了一封公开信。新语丝等网站和网络论坛转载了何祚庥的公开信。

在这封公开信中，何祚庥向尚勇提出9点质疑：1）这一从脉息"判断男女"的原理是什么？2）有多少实验事例足以支撑这一"重大成就"？3）在实验进程中有无相应的对照组？4）采用什么措施保证了诊断者和被诊断者之间的"双盲"？5）其最终的判断的精度有多大？6）其判断的精度和胎儿怀孕的时间关系如何？7）什么单位，哪几位系统生物学工作者从事了这样的科学实验？8）这一成果是否已公开发表，或发表在什么刊物上？9）这一成就是否已得到生物界和医学界的承认？

何祚庥同时向卫生部部长陈竺发问，"是否认同这是系统生物学的一项成就？"。

事隔近4个多月，河南的《东方今报》公开报道了此事。http://news.sina.com.cn/c/2007-11-17/025812918612s.shtml

该报记者采访了河南中医学院三附院的两位名中医。内科主任医师、65岁的刘永业教授说，从脉络上判断胎儿性别的可能性不大，目前尚无公开刊物发表过"号脉能判断胎儿性别"成果的论文，中医界也没有这方面的共识，"科技部副部长的说法不靠谱"。 著名妇科专家、主任医师庞玉琴也说，有人声称能以号脉诊断胎儿性别，就是事后被证明"号对了"，那也是蒙人，因为胎儿非男即女，有50%的可能性蒙对。号脉是望闻问切的一种手段，好中医能仅仅通过摸孕妇的中指，可以判断出怀孕几个月了，甚至可以判断大致预产期，这是科学，但是要说"号脉诊断胎儿性别"，那就是伪科学了。

科技部副部长尚勇没有医学背景，其简历如下：

1982年毕业于山东矿业学院机械系机械制造专业。1984、1987年分别于中国矿业大学北京研究生部矿山工程力学专业研究生毕业，获工学硕士、博士学位。2005年8月至2006年1月以高级研究员身份赴美国哈佛大学肯尼迪政府学院研修。历任中国矿业大学研究生部讲师、副教授、研究生部副主任、国家科委调研室副主任、办公厅副主任、国家科委政策法规与体制改革司司长、科技部政策法规与体制改革司司长。2001年4月任科技日报社社长(副部级)，2001年11月起，任科学技术部党组成员。2004年1月起，任科学技术部副部级党组成员。2004年12月起，任科学技术部副部长。http://www.most.gov.cn/zzjg/bld/sy/index.htm